
Sandra Soukup
Chercheuse
/ Université de Bordeaux/ Contact
+ 33 (0)5 33 51 48 34
/ Webpage
http://soukup-lab.eu/
www.orcid.org/0000-0003-2915-919X

Dès mes études en neurosciences, j’ai été fascinée par l’organisme modèle de la drosophile, et plus précisément au cours de mon mémoire de maîtrise dans le laboratoire du professeur Karl-Friedrich Fischbach (Université de Fribourg, Allemagne), où j’ai étudié le système Robo-Slit dans la recherche de la trajectoire axonale. Au cours de mon doctorat dans le laboratoire du Dr David Gubb (CIC bioGUNE, Espagne), j’ai continué à utiliser ce modèle pour explorer le rôle de la nécrose – un inhibiteur de la sérine-protéase dont l’homologue humain le plus proche est la serpine en phase aiguë α1-antitrypsine – dans la réponse immunitaire innée.
Après mon doctorat, j’ai rejoint le groupe du professeur Elisabeth Knust (Institut Max Plank de biologie cellulaire et de génétique, Dresde), où j’ai disséqué un mécanisme par lequel les complexes postsynaptiques peuvent contrôler l’homéostasie présynaptique (Curr. Biol. 2013) dans la rétine. J’ai beaucoup apprécié le domaine de l’homéostasie synaptique et de la neurodégénérescence et j’ai déménagé en Belgique pour travailler dans le laboratoire du Prof. Patrik Verstreken (VIB/KU Leuven, Belgique) où j’ai apporté des contributions importantes au domaine de la fonction synaptique et de la neurodégénérescence (Neuron 2016). Pendant cette période, j’ai participé à des activités d’enseignement et j’ai supervisé et dirigé une petite équipe ; en même temps, j’ai développé un réseau travaillant avec des collaborateurs locaux et internationaux pour continuer à disséquer le rôle de l’autophagie au niveau de la synapse ((EMBO J 2017).
A partir de 2018, je suis devenue chef d’équipe à l’Institut des maladies neurodégénératives (IMN) où j’ai obtenu une chaire junior d’IdEx. Mon équipe avait pour objectif de comprendre pourquoi des neurones auparavant sains commencent à mourir dès l’apparition précoce de maladies neurodégénératives. Nous avons donc exploré les mécanismes moléculaires du contrôle local de la qualité des protéines, comme l’autophagie et la libération d’exosomes au niveau des compartiments synaptiques et dans le circuit cérébral de l’intestin. Pour atteindre cet objectif, nous avons utilisé des approches multidisciplinaires comprenant le CLEM, la microscopie à super-résolution, l’imagerie en direct, les vésicules unilamellaires géantes (GUV) chez la drosophile et les neurones humains dérivés de l’iPSC.
Publications
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Synaptogyrin regulates neuronal activity dependent autophagy to degrade synaptic vesicle components and pathological Tau
Sergio Hernandez-Diaz, Pilar Martinez-Olondo, Irene Sanchez-Mirasierra, Carla Montecinos, Saurav Ghimire, Sandra-Fausia Soukup.
prePrint bioRXiv. 2023-07-04.
10.1101/2023.07.04.547658 -
Endophilin-A/SH3GL2 calcium switch for synaptic autophagy induction is impaired by a Parkinson’s risk variant
Marianna Decet, Sandra-Fausia Soukup.
Autophagy. 2023-04-17. : 1-3.
10.1080/15548627.2023.2200627 -
EndophilinA-dependent coupling between activity-induced calcium influx and synaptic autophagy is disrupted by a Parkinson-risk mutation
Adekunle T. Bademosi, Marianna Decet, Sabine Kuenen, Carles Calatayud, Jef Swerts, Sandra F. Gallego, Nils Schoovaerts, Spyridoula Karamanou, Nikolaos Louros, Ella Martin, Jean-Baptiste Sibarita, Katlijn Vints, Natalia V. Gounko, Frédéric A. Meunier, Anastassios Economou, Wim Versées, Frederic Rousseau, Joost Schymkowitz, Sandra-F. Soukup, Patrik Verstreken.
Neuron. 2023-02-01.
10.1016/j.neuron.2023.02.001 -
Editorial: Autophagy in the central nervous system: Focus on neurons, glia and neuron-glia interactions
Maria Jimenez-Sanchez, Olatz Pampliega, Sandra-Fausia Soukup.
Front. Cell Dev. Biol.. 2022-10-12. 10
10.3389/fcell.2022.1036587 -
Targeting Macroautophagy as a Therapeutic Opportunity to Treat Parkinson’s Disease
Irene Sanchez-Mirasierra, Saurav Ghimire, Sergio Hernandez-Diaz, Sandra-Fausia Soukup.
Front. Cell Dev. Biol.. 2022-07-06. 10
10.3389/fcell.2022.921314 -
EndophilinA-dependent coupling between activity-dependent calcium influx and synaptic autophagy is disrupted by a Parkinson-risk mutation
Adekunle T. Bademosi, Marianna Decet, Sabine Kuenen, Carles Calatayud, Jef Swerts, Sandra F Gallego, Nils Schoovaerts, Nikolaos Louros, Ella Martin, Spyridoula Karamanou, Jean-Baptiste Sibarita, Katlijn Vints, Natalia V. Gounko, Frédéric A. Meunier, Anastassios Economou, Wim Versées, Frederic Rousseau, Joost Schymkowitz, Sandra-F. Soukup, Patrik Verstreken.
. 2022-04-30.
10.1101/2022.04.29.490010 -
Endophilin-B regulates autophagy during synapse development and neurodegeneration
Sergio Hernandez-Diaz, Saurav Ghimire, Irene Sanchez-Mirasierra, Carla Montecinos-Oliva, Jef Swerts, Sabine Kuenen, Patrik Verstreken, Sandra-Fausia Soukup.
Neurobiology of Disease. 2022-02-01. 163 : 105595.
10.1016/j.nbd.2021.105595 -
Altered autophagy on the path to Parkinson’s disease
Irene Sanchez-Mirasierra, Sergio Hernandez-Diaz, Saurav Ghimire, Patrick Main, Sandra-Fausia Soukup.
Autophagy in Health and Disease. 2022-01-01. : 271-286.
10.1016/b978-0-12-822003-0.00006-1 -
Macros to Quantify Exosome Release and Autophagy at the Neuromuscular Junction of Drosophila Melanogaster
Irene Sanchez-Mirasierra, Sergio Hernandez-Diaz, Saurav Ghimire, Carla Montecinos-Oliva, Sandra-Fausia Soukup.
Front. Cell Dev. Biol.. 2021-11-15. 9
10.3389/fcell.2021.773861 -
The role of lipids in autophagy and its implication in neurodegeneration.
Sergio Hernandez-Diaz, Sandra-Fausia Soukup.
CST. 2020-07-13. 4(7) : 167-186.
10.15698/cst2020.07.225 -
Parkinson’s disease: convergence on synaptic homeostasis
Sandra‐Fausia Soukup, Roeland Vanhauwaert, Patrik Verstreken.
EMBO J.. 2018-07-31. 37(18) : e98960.
10.15252/embj.201898960 -
The SAC1 domain in synaptojanin is required for autophagosome maturation at presynaptic terminals.
Roeland Vanhauwaert, Sabine Kuenen, Roy Masius, Adekunle Bademosi, Julia Manetsberger, Nils Schoovaerts, Laura Bounti, Serguei Gontcharenko, Jef Swerts, Sven Vilain, Marina Picillo, Paolo Barone, Shashini T Munshi, Femke MS de Vrij, Steven A Kushner, Natalia V Gounko, Wim Mandemakers, Vincenzo Bonifati, Frederic A Meunier, Sandra‐Fausia Soukup, Patrik Verstreken.
EMBO J.. 2017-03-22. 36(10) : 1392-1411.
10.15252/embj.201695773 -
EndoA/Endophilin-A creates docking stations for autophagic proteins at synapses
Sandra-Fausia Soukup, Patrik Verstreken.
Autophagy. 2017-02-15. 13(5) : 971-972.
10.1080/15548627.2017.1286440 -
Endocytosis and Synaptic Function
S.F. Soukup, P. Verstreken, S. Vilain.
Parkinson's Disease. 2017-01-01. : 207-243.
10.1016/b978-0-12-803783-6.00007-9 -
A LRRK2-Dependent EndophilinA Phosphoswitch Is Critical for Macroautophagy at Presynaptic Terminals.
Sandra-Fausia Soukup, Sabine Kuenen, Roeland Vanhauwaert, Julia Manetsberger, Sergio Hernández-Díaz, Jef Swerts, Nils Schoovaerts, Sven Vilain, Natalia V. Gounko, Katlijn Vints, Ann Geens, Bart De Strooper, Patrik Verstreken.
Neuron. 2016-11-01. 92(4) : 829-844.
10.1016/j.neuron.2016.09.037 -
Endophilin-A Deficiency Induces the Foxo3a-Fbxo32 Network in the Brain and Causes Dysregulation of Autophagy and the Ubiquitin-Proteasome System.
John D. Murdoch, Christine M. Rostosky, Sindhuja Gowrisankaran, Amandeep S. Arora, Sandra-Fausia Soukup, Ramon Vidal, Vincenzo Capece, Siona Freytag, Andre Fischer, Patrik Verstreken, Stefan Bonn, Nuno Raimundo, Ira Milosevic.
Cell Reports. 2016-10-01. 17(4) : 1071-1086.
10.1016/j.celrep.2016.09.058 -
Fast and efficient Drosophila melanogaster gene knock-ins using MiMIC transposons.
Sven Vilain, Roeland Vanhauwaert, Ine Maes, Nils Schoovaerts, Lujia Zhou, Sandra Soukup, Raquel da Cunha, Elsa Lauwers, Mark Fiers, Patrik Verstreken.
G3. 2014-10-08. 4(12) : 2381-2387.
10.1534/g3.114.014803 -
PIWIL1 protein power targets tau therapy
Sandra-Fausia Soukup, Patrik Verstreken.
Nat Neurosci. 2014-03-01. 17(3) : 334-335.
10.1038/nn.3659 -
DLin-7 Is Required in Postsynaptic Lamina Neurons to Prevent Light-Induced Photoreceptor Degeneration in Drosophila
Sandra-Fausia Soukup, Shirin Meher Pocha, Michaela Yuan, Elisabeth Knust.
Current Biology. 2013-07-01. 23(14) : 1349-1354.
10.1016/j.cub.2013.05.060 -
Uptake of the Necrotic Serpin in Drosophila melanogaster via the Lipophorin Receptor-1
Sandra Fausia Soukup, Joaquim Culi, David Gubb.
PLoS Genet. 2009-06-26. 5(6) : e1000532.
10.1371/journal.pgen.1000532