Transcriptomic
Transcriptome

Neurocentre Magendie

Confiez nous vos échantillons! Nous offrons un service complet.

La plateforme transcriptome du Neurocentre Magendie effectue des études d’expression de gènes dans le cadre de projets scientifiques dans divers tissus chez la souris, le rat, l’homme…

Notre équipement automatisé en PCR quantitative en temps réel (LightCycler 480 Roche + TwisterII Caliper) nous permet de réaliser jusqu’à 20 plaques 96 puits ou 384 puits par jour. Plus de 6500 couples d’amorces sont répertoriés dans notre base de données. Notre équipements de pointe en PCR numérique (QX200 Droplet Digital PCR Bio-Rad) permet de réaliser différentes quantifications absolues sans réplicat technique ni gamme étalon (expression de gènes faiblement exprimés, quantification de stocks viraux…). Nous avons également développé des stratégies pour la RT-PCR sur cellule unique (patch clamp, tri cellulaire, microdissection laser …).

Nous proposons les services suivants: – Extraction d’acides nucléiques et de protéines – Quantification des acides nucléiques – Contrôle qualité de l’ARN total – Synthèse d’ADNc avec contrôle qualité (protocoles adaptés aux quantités d’ARN) – Conception et validation des amorces de PCR – PCRq avec chimies Sybrgreen ou sonde Taqman (ADNg, ADNc, micDNA) – ddPCR avec chimie Evagreen (quantification absolue) – Sélection des contrôles appropriés pour PCRq et ddPCR – RT-PCR sur cellule unique

La plate-forme transcriptomique est au service de tous les membres du Neurocentre Magendie et est également accessible à toute la communauté scientifique (utilisateurs publics et privés).



English version

Entrust us with your samples! We offer a full service.

Neurocentre Magendie’s Transcriptomic Platform performs gene expression studies as part of scientific projects in various tissues in mice, rats, humans…

Our automated equipment in quantitative PCR (LightCycler 480 Roche + TwisterII Caliper) allows us to handle 20 plates 96 wells or 384 wells a day. More than 6500 couples of primers are listed in our database.
Our advanced equipment in digital PCR (QX200 Droplet Digital PCR Bio-Rad) makes it possible to realize various absolute quantifications without technical replication and standard range (expression of weakly expressed genes, quantification of viral stocks …).
We have also developed strategies for single-cell RT-PCR (patch clamp, cell sorting, laser microdissection…).

We propose the following services:
– Extraction of nucleic acids and proteins
– Quantification of nucleic acids
– Quality control of total RNA
– CDNA synthesis with quality control (protocols adapted to the quantities of RNA)
– Design and validation of PCR primers
– qPCR with Sybrgreen chemistries or Taqman probe (gDNA, cDNA, micDNA)
– ddPCR with Evagreen chemistry (absolute quantification)
– Selection of appropriate controls for qPCR and ddPCR
– Single cell RT-PCR

Transcriptomic Platform is at the service of all Neurocentre Magendie members and also accessible to all the scientific community (public and private users).



Responsable(s)

Membres de l'équipe

Carla Gilg (Ingénieur/technicien)
Hélène Doat (Ingénieur/technicien)
Thierry Lesté-Lasserre (Ingénieur/technicien)