Transcriptomic
Transcriptome
La plateforme Transcriptome se divise en deux services :
Etude de l’expression de gènes par qPCR et dPCR
Nous vous accompagnons dans la réalisation de votre projet d’étude d’expression des gènes : de l’extraction des acides nucléiques à l’analyse et à l’interprétation des résultats à l’aide d’un logiciel accessible en ligne développé par le Neurocentre Magendie spécifiquement pour l’analyse des données transcriptomiques : GEASE.
Séquençage haut débit (NGS)
La technologie NGS permet d’analyser à haut débit et sans à priori toutes les molécules d’ARN d’un échantillon. Sur la plateforme, nous vous proposons un service de préparation des librairies, de séquençage haut débit (Next Generation Sequencing – NGS) et d’analyses des données obtenues. Le séquençage des librairies est effectué en collaboration avec la plateforme Génome Transcriptome de Bordeaux (INRAe PGTB). Nous vous proposons plusieurs types d’analyses afin de répondre au mieux à vos projets.
Selected publications
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Placental Extracellular Vesicles Exhibit Reduced Neurogenic Potential Linked to Changes in Their miRNA Landscape Upon HCMV Infection
Charlène Martin, Hélène Martin, Mathilde Bergamelli, Lhorane Lobjois, Lucie Franco, Emma Bordes, Alexandra Benchoua, Stéphanie Balor, Diala Kantar, Etienne Coyaud, Frédéric Martins, Alexandre Favereaux, Cécile E. Malnou.
Journal of Extracellular Biology. 2026-01-01. 5 (1)
DOI: 10.1002/jex2.70108 -
Blood vessel and osteocyte networks concurrently rearrange during bone maturation and decline during aging in the femur of male mice
Mathilde Palmier, Marlène Maître, Hélène Doat, Thierry Lesté-Lasserre, Claudine Boiziau, Delphine B. Maurel.
Aging. 2025-08-22.
DOI: 10.18632/aging.206302 -
Developmental alterations of indirect-pathway medium spiny neurons in mouse models of Huntington’s disease
Margaux Lebouc, Léa Bonamy, Thibault Dhellemmes, Jakob Scharnholz, Quentin Richard, Gilles Courtand, Alexandre Brochard, Frédéric Martins, Marc Landry, Jérôme Baufreton, Maurice Garret.
Neurobiology of Disease. 2025-05-01. 208 : 106874.
DOI: 10.1016/j.nbd.2025.106874 -
Nanoscopic Mapping of the Extracellular Space in Amyloid Plaque‐rich Cortex
Juan Estaún‐Panzano, Yulia Dembitskaya, Ivo Calaresu, Somen Nandi, Quentin Gresil, Evelyne Doudnikoff, Thierry Leste‐Laserre, Thierry Amédée, Laurent Cognet, Laurent Groc, Urs Valentin Nägerl, Erwan Bezard.
Advanced Science. 2025-10-24. 13 (1)
DOI: 10.1002/advs.202515674 -
GLP-1-mediated targeting of inflammation corrects obesogenic memory in male mice
Stéphane Léon, Julie Benoit, Samantha Clark, Philippe Zizzari, Bin Yang, Isabelle Dugail, Fatiha Merabtene, Karine Clement, Louise Eygret, Nathalie Dupuy, Jean-Christophe Delpech, Moïra Rossitto, Matthias Mack, Thierry Lesté-Lasserre, Brian Finan, Daniela Cota, Carmelo Quarta.
Diabetes. 2025-04-11.
DOI: 10.2337/db24-1071 -
A novel role for CAMKIIβ in the regulation of cortical neuron migration: implications for neurodevelopmental disorders.
Olivier Nicole, Donald M. Bell, Thierry Leste-Lasserre, Hélène Doat, François Guillemot, Emilie Pacary.
Mol Psychiatry. 2018-04-30.
DOI: 10.1038/s41380-018-0046-0
Frédéric Martins Martins (Ingénieur d'études)
Hélène Doat Doat (Ingénieur/technicien)
Thierry Lesté-Lasserre Lesté-Lasserre (Ingénieur/technicien)
Vanessa Rouglan Rouglan (Technicienne)
Alexandre Darrius-Laplace Darrius-Laplace (Technicien)
Romain Szczepaniak Szczepaniak (Technicien)