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SUMMARY:Cajal lectures: "Neuroimmunology in Physiology and Disease: From Fundamental Concepts to Hands-on Training"
DESCRIPTION:Venue : CARF \nOrganized by the Bordeaux School of Neuroscience. \nLectures are open to everyone. \n\nNovember 26 – 9:00am \nSonia Garel (Institut de Biologie de l’École Normale Supérieure\, France)\nMicroglia in early brain construction. \nNovember 26 – 11:00am\n Michael Heneka (Luxemburg University\, Luxemburg)\nTunneling nanotubes as rescue routes between microglia and neurons \nNovember 27 – 9:00am \nAndrew Greenhalgh (University of Manchester\, UK)\nNavigating a career in neuroimmunology. \nNovember 28 – 9:00am \n Renzo Mancuso  (VIB\, Antwerp\, Belgium)\nElucidating the role of human microglia in neurodegeneration \nNovember 28 – 11:00am \nArthur Liesz (Ludwig-Maximilians Munich University\, Germany)\nImmunological brain-body interaction after stroke. \nDecember 1 – 9:00am \nRejuane Rua (Centre d’Immunologie de Marseille Luminy\, France)\nBrain border macrophages : more than immune sentinels? \nDecember 3 – 9:00am \nMichal Schwartz (Weizmann Institute of Science\, Israel)\nTBA \nDecember 3 – 11:00am \nAleksandra Deczkowska (Institut Pasteur\, France)\nImmune regulation of brain physiology. \nDecember 5 – 9:00am \nLaurent Groc (University of Bordeaux\, CNRS\, France)\nDecrypting pathogenic brain autoantibody at the molecular level. \nDecember 4 – 5:00pm \nJonathan Kipnis (Washington University School of Medicine\, USA)\nWhat is CNS immune privilege? An update. \nCourse Directors \n\nRosa Chiara Paolicelli – University of Lausanne\, Switzerland\nAgnes Nadjar – Neurocentre Magendie\, University of Bordeaux\, France\nStefano Pluchino – University of Cambridge\, UK\n\n
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CATEGORIES:Cajal Lectures,Pour les scientifiques
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SUMMARY:Symposium: The Impact of philosophical thinking on today’s neuroscience
DESCRIPTION:Venue: IBGC – Campus Carreire\n \nOn registration (see link below) \n\nSpeakers\n\nSerge Ahmed (CNRS Research Director in neuroscience\, Incia\, Bordeaux\, FR)\nHéloïse Athea (Postdoctoral researcher in philosophy\, Gustave Roussy\, Villejuif\, FR)\,\nJohn Bickle (Professor\, Philosophy and History of Neuroscience\, Mississippi State University\, USA)\nElodie Boissard (Postdoctoral researcher in philosophy\, Incia\, Bordeaux & IHPST\, Paris\, FR)\nThomas Boraud (CNRS Research Director in neuroscience & Director of Institute of Neurodegenerative Diseases\, Bordeaux\, FR)\, with Cédric Brun\nThomas Pradeu (CNRS Research Director in Philosophy of Science\, ImmunoConcept\, Bordeaux\, FR)\nChristopher Stevens (Postdoctoral researcher in philosophy and neuroscience\, ImmunoConcept\, Bordeaux\, FR)\nPaul Thagard (Distinguished Professor Emeritus of Philosophy at the University of Waterloo\, CA)\nMarco Viola (Assistant Professor\, University of Roma 3\, Italy)\n\nAbstracts\nSee https://philinbiomed.cnrs.fr/event/philosophy-impact-neuroscience/ \nScientific program\nDay 1\, Monday 24th\n10.00-10.30 Welcome coffee \n10.30 – Marco Viola\nFrom dotted to continuous line: Scientometric evidence for a strengthened (though not flat) relationship between philosophy and neuroscience \n11.30 – Thomas Pradeu\nFrom philosophy in science to philosophy in neuroscience \n12.30 Lunch (buffet open to all participants) \n14.00 – Héloise Athéa\nWhat is cellular memory? From bench to philosophical side and back again \n15.00 – Lisa Roux\nTBA \n16.00 Coffee break \n16.30 – John Bickle\nExploratory research in neurobiology: a case study \n17.30-18.30 – Panel discussion.\nChair: Aline Desmedt. \nDay 2\, Tuesday 25th\n10.00-10.30 Welcome coffee \n10.30 – Christopher Stevens\nPhilosophical Thinking in Neuroscience: Zones of Impact \n11.30 – Serge Ahmed\nPhilosophers and the neurosciences of addiction \n12.30 Lunch (buffet open to all participants) \n14.00 – Elodie Boissard\nBrentano’s thesis of intentionality as the mark of the mental and the birth of experimental and clinical psychology \n15.00 – Thomas Boraud & Cédric Brun\nOne Decision\, Two concepts: A call for Philosophical Clarification \n16.00 Coffee break \n16.30 – Paul Thagard\nPhilosophical Contributions to Theoretical Neuroscience \n17.30-18.30 – Panel discussion.\nChair: Cédric Brun \nRegistration\nFree but mandatory. \nPlease register here:\nhttps://framadate.org/PoEN4TkULIrJCoe8 \n
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SUMMARY:Journée des plateformes
DESCRIPTION:Bordeaux Neurocampus organise la deuxième édition de sa Journée des plateformes le mardi 25 novembre prochain au centre Broca Nouvelle-Aquitaine et sur les différentes plateformes. \nL’objectif ? Vous faire découvrir la richesse et la diversité de nos expertises techniques\, favoriser les échanges entre plateformes\, utilisateurs et partenaires\, et envisager de nouvelles formes de collaborations. \nCet événement se déroulera en trois temps : des présentations courtes dans l’auditorium du centre Broca et des discussions autour de stands le matin\, et des visites de plateformes l’après-midi. \nL’inscription est obligatoire.  \nProgramme\n9h00 – Café d’accueil \n9h30- 10h50 – Présentations orales\n/ Lieu : auditorium du Centre Broca\n \n9h30 – Département Bordeaux Neurocampus\, par Jérôme Baufreton \nL’innovation à l’université\n9h35 – The Hub\, par Marietta Dromain\n9h40 – Service DIESE (Direction du développement par l’innovation\, l’entrepreneuriat\, et le lien avec les acteurs socio-économiques) par Lorena Delgado-Zabalza\n9h45 – Fédération des Plateformes\, par Frédérique Pougnet \nLes plateformes de Bordeaux Neurocampus\n9h50 – Aquatique\n9h55 – BioCell\n10h00 – BioProt\n10h05 – Bordeaux Imaging Center\n10h10 – HistoCARE\n10h15 – PAM\n10h20 – PARCA\n10h25 – PIV-EXPE\n10h30 – PRNPP\n10h35 – PUMA\n10h40 – RACIN\n10h45 – Vectorologie\n10h50 – Ecole des Neurosciences \n11h00 : Stands\, posters\, démonstrations de matériels\n/ Lieu : atrium du centre Broca \n12h30 : Déjeuner \n14h00 : Visites de plateformes \nPour la visite de plateformes\, merci de consulter la liste sur https://www.bordeaux-neurocampus.fr/recherche/plateformes/ pour faire votre choix. Ecrire ensuite à julia.goncalves@u-bordeaux.fr \n16h30 : Wine & cheese & goûter \nFormulaire d’inscription\nhttps://framaforms.org/journee-des-plateformes-de-bordeaux-neurocampus-25112025-1675856027 \n  \n
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SUMMARY:Soutenance d'HDR - Jérôme Aupy
DESCRIPTION:Salle Module 2.6 (à côté du R.U.\, campus Carreire)\n \n\nJérôme Aupy\nMCU PH\nEquipe : Dynamique des Réseaux de l’Apprentissage Procédural (Leblois / Mallet)\nIMN \n\n\nJérôme Aupy est professeur associé à l’université de Bordeaux et praticien hospitalier\, coordinateur du Centre des épilepsies rares du CHU de Bordeaux. Il est chercheur à l’Institut des maladies neurodégénératives (IMN\, Bordeaux Neurocampus). Ses travaux HDR explorent les réseaux cortico-sous-corticaux dans les épilepsies focales et leurs liens avec les comorbidités psychiatriques\, en combinant des enregistrements intracérébraux\, la neuroimagerie et des approches cognitives afin de mieux comprendre la dynamique neuronale sous-jacente à l’épilepsie et au comportement. \nTitre\nRéseaux cortico-sous-corticaux dans les épilepsies focales et comorbidités psychiatriques associées \n\n\nJury\nM Philippe DERAMBURE\, Professeur des Universités\, Université de Lille – Rapporteur\nM Pascal BENQUET\, Professeur des Universités\, Université de Rennes – Rapporteur\nM Thomas Michelet\, Maître de Conférence Universitaire\, Université de Bordeaux – Rapporteur\nM Dominique GUEHL\, Professeur des Universités\, Université de Bordeaux – Examinateur\nMme Aileen McGONIGAL\, Professeur des Universités\, University of Queensland – Examinatrice\nM Pierre BURBAUD\, Professeur des Universités\, Université de Bordeaux – Examinateur \n\n
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SUMMARY:Soutenance de thèse - Laetitia Bettarel
DESCRIPTION:Lieu : Centre Broca \n\nLaetitia Bettarel\nÉquipe : Imagerie quantitative de la cellule (Sibarita)\nIINS \nTitre\n\nImagerie de super-résolution par localisation de molécules uniques en profondeur dans des modèles 3D multicellulaires à l’aide d’optique adaptative et de façonnage de PSF \nRésumé\n\nL’évaluation de l’organisation et de la dynamique des protéines dans leur contexte cellulaire natif fournit des informations clés sur les mécanismes moléculaires qui gouvernent le fonctionnement cellulaire. La microscopie de super-résolution fut une avancée majeure à cet égard\, permettant d’importantes découvertes en biologie cellulaire\, développementale et en neurobiologie. Parmi ces techniques\, la microscopie de localisation de molécules uniques (SMLM) permet de localiser\, suivre et compter ces biomolécules dans leur environnement cellulaire avec une résolution nanométrique. Cependant\, l’imagerie SMLM conventionnelle est limitée par sa faible profondeur de pénétration\, empêchant ainsi l’étude de nombreux processus biologiques. Réaliser de la SMLM en profondeur au sein d’échantillons multicellulaires complexes pose donc plusieurs défis : obtenir un sectionnement optique efficace tout en conservant une bonne collection de photons\, et corriger les aberrations optiques introduites à la fois par le système et par l’échantillon\, qui brouillent les signaux des molécules uniques et compromettent la précision et la justesse de la localisation de ces dernières. \nPour relever ces défis\, nous avons développé au sein de l’équipe un microscope à feuille de lumière\, appelée soSPIM\, qui permet l’imagerie en profondeur de molécules uniques. En parallèle\, l’optique adaptative (AO) est devenue une solution puissante pour corriger les aberrations induites par le système et/ou l’échantillon et ainsi améliorer la qualité d’image en profondeur. Récemment\, nous avons combiné le soSPIM avec l’AO afin de réaliser de l’imagerie 3D SMLM en profondeur à l’échelle de la cellule entière. Toutefois\, cette implémentation repose encore sur des marqueurs fiduciaires situés à proximité de l’échantillon\, ce qui empêche la correction efficace des aberrations induites par l’échantillon\, qui sont particulièrement significatives dans les systèmes multicellulaires. De plus\, elle utilise des approches de localisation 3D conventionnelles\, non optimales pour une localisation rapide et précise de molécules uniques en profondeur. Dans ce contexte\, mes travaux de thèse se sont concentrés sur le développement de solutions méthodologiques cherchant à étendre l’applicabilité de la plateforme d’imagerie AO-soSPIM à la SMLM en profondeur dans des échantillons 3D complexes. \nDans un premier temps\, j’ai développé un algorithme d’AO entièrement personnalisé en Python\, permettant un contrôle complet de tous les paramètres de la boucle de correction\, y compris dans le choix de métriques définies par l’utilisateur et spécifiquement adaptées à la modalité d’imagerie et au type d’échantillon. À partir de cela\, j’ai établi un cadre systématique pour évaluer des métriques basées sur les images SMLM sans fiduciaires et d’identifier les plus sensibles et robustes en profondeur. \nDans un second temps\, j’ai exploré des méthodes de localisation de molécules uniques basés sur l’apprentissage profond\, exploitant des modèles de PSF issus des données afin d’améliorer à la fois la robustesse de la localisation et la vitesse d’imagerie\, offrant ainsi une alternative prometteuse au fit gaussien conventionnel dans les ensembles de données SMLM 3D denses ou complexes. J’ai également étudié des stratégies de modélisation expérimentale de la PSF pour mieux prendre en compte les aberrations résiduelles et les déformations complexes de la PSF en profondeur. Ces approches\, qui décrivent la PSF au-delà de l’approximation gaussienne\, visent à améliorer la précision et la justesse de localisation dans des conditions aberrantes. Dans l’ensemble\, ces développements méthodologiques établissent un pipeline robuste pour la SMLM 3D corrigée au sein d’échantillons biologiques complexes. Ce travail élargit le champ d’application de la microscopie super-résolutive vers des modèles 3D physiologiquement pertinents tels que les sphéroïdes et les organoïdes. \nPublication\nCabillic\, M.\, Forriere\, H.\, Bettarel\, L. et al.\, In-depth single molecule localization microscopy using adaptive optics and single objective light-sheet microscopy. Nat Commun 16\, 8362 (2025). https://doi.org/10.1038/s41467-025-62198-8. \nJury\n– Rémi GALLAND : Directeur de thèse\n– Laurent COGNET: Examinateur\n– Alexandra FRAGOLA: Rapporteuse\n– Lydia DANGLOT: Rapporteuse\n– Jean-Baptiste SIBARITA: Invité \n\n
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CATEGORIES:Thèses
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