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SUMMARY:Exposition : Cervorama
DESCRIPTION:Agitez vos neurones ! \nA travers cette exposition\, Cap Sciences propose aux visiteurs de découvrir le cerveau sous toutes ses formes lors d’une visite ponctuée de manipulations\, de jeux et d’expériences… Ils pourront notamment explorer les mondes des cerveaux de l’escargot\, l’abeille\, le singe et l’homme\, tester leur mémoire dans le « cognitilab »\, découvrir leur cerveau en 3D grâce au cervomaton ou encore analyser les capacités des animaux ! \nUne exposition conçue et réalisée par Cap Sciences en partenariat avec Bordeaux Neurocampus\n \nEn savoir plus\nSite web : https://www.cap-sciences.net/au-programme/exposition/grand-public/cervorama/ \n
URL:https://www.bordeaux-neurocampus.fr/event/exposition-cervorama/
CATEGORIES:Evénements pour tous,not-calendar,pour tous homepage,Semaine du cerveau 2024
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SUMMARY:Cajal lectures: Connectomics from micro- to meso- and macro-scales
DESCRIPTION:Venue: CGFB \n\nCourse directors\nGregory Jefferis\, MRC LMB and University of Cambridge\, UK\nJinny Kim\, Korea Institute of Science and Technology\, Korea\nNicolas Renier\, Paris Brain Institute\, France\nCasey Schneider-Mizell\, Allen Institute of Brain Science\, US \nLectures\nSeptember 19 – 9:00am\nValentin Naegerl (Bordeaux University\, France)\nSTED imaging of brain microanatomy. \nSeptember 21 – 9:00am\nClaire Wyart (ICM Institute for Brain and Spinal Cord\, France)\nOptical methods to probe Connectivity of sensorimotor circuits in brainstem and spinal cord. \nSeptember 23 – 9:00am\nJae-Byum Chang (Korea Advanced Institute of Science and Technology\, KAIST\, Korea)\nSuper-resolution imaging of whole mouse embryos via whole-body expansion microscopy. \nSeptember 25 – 9:00am\nAlexandra Pacureanu (European Synchrotron Radiation Facility\, France)\nTBA \nSeptember 26 – 9:00am\nJonny Kohl (Francis Crick Institute \, UK)\nForm\, function and flexibility of parenting circuits. \nSeptember 28 – 9:00am\nMoritz Helmstaedter (Max Planck Institute for Brain Research\, Germany)\nCerebral Cortex Connectomics. \nSeptember 29 – 9:00am\nHiroki Ueda (UTokyo/RIKEN BDR\, Japan)\nTowards Human Systems Biology of Sleep/Wake Cycles: Phosphorylation Hypothesis of Sleep. \nOctober 2 – 9:00am\nConstantin Pape (Georg August Universität Göttingen\, Germany)\nInstance Segmentation Methods for Large Volumetric EM. \nOctober 3 – 9:00am\nChristel Genoud (University of Lausanne\, Switzerland)\nVolumeEM techniques to study the central nervous system. \nOctober 3 – 11:00am\nCasey Schneider-Mizell (Allen Institute of Brain Science\, USA)\nTBA \nAbout the Cajal lectures\nThe Cajal lectures are organized in the frame of the Cajal courses\, located in the Bordeaux school of Neuroscience. They are open to everyone. \nMore details about this course:\nhttps://cajal-training.org/on-site/connectomics/ \n
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CATEGORIES:Cajal Lectures,Pour les scientifiques
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SUMMARY:Expansion Microscopy Workshop
DESCRIPTION:Date : October 2nd\, 2023 \nVenue: Centre Broca Nouvelle-Aquitaine \nRegistration are closed for lunch… but access to talks is free! \n\nExpansion microscopy (ExM) is a relatively new super-resolution method based in the isotropic dilatation of the biological sample in order to overcome the diffraction limit of conventional microscopy. Since its development in 2014\, many laboratories have been implementing and adapting the technique to their needs\, and the biological applications of ExM grow exponentially. \nThe ExM working group from the French fluorescence microscopy network (rtMFM)\, with the support of France BioImaging\, is organizing a workshop on ExM at Bordeaux the 2nd of October 2023. \nDuring the workshop\, different aspects of ExM protocols will be covered with experts in biochemistry and biology\, and examples of biological applications we will presented. \n\nInvited speakers\nMarine Laporte (Institut NeuroMyoGène\, Université Claude Bernard\, Lyon). \nSven Truckenbrodt (E11 Bio\, Alameda\, California\, US). \nMaxence Wisztorski (University of Lille\, Inserm\, CHU Lille\, U1192). \nProgram\nDownload the program (pdf)  \n  \n  \n  \n  \n  \n
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CATEGORIES:A la une,Pour les scientifiques,Symposiums
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SUMMARY:Semaine Défi Mobilité des Comités Transitions de Bordeaux Neurocampus
DESCRIPTION:Pour entamer cette rentrée de bon pied\, les Comités Transitions des instituts du Bordeaux Neurocampus lancent la Semaine Défi Mobilité !🚲 \n🎯Son but ? Challenger vos habitudes de déplacements Domicile – Travail vers des solutions plus respectueuses de l’environnement \n🤔Comment ? co-voiturage\, transports en commun\, vélo\, trottinette\, marche\,… \n📅Quand ? Du Lundi 1er au Vendredi 6 octobre 2023 \n🎁A la clef ? Un bilan de ses actions et des cadeaux (lors d’un événement convivial : mardi 10 octobre) \nC’est quoi la Semaine Défi Mobilité ?👟🌱 \n\nModifier ses habitudes de trajet domicile – travail vers des solutions plus écoresponsables durant ses jours travaillés (01/10 au 06/10)\nLundi 09/10 : comparer les émissions de gaz à effet de serre d’une semaine de ses déplacements types par rapport à ceux réalisés lors de cette semaine de défi grâce à l’outil du GDR Labo1point5 (https://labos1point5.org/commutes-simulator)\nRépondre au sondage que nous vous enverrons le Mardi 10/10 afin de rapporter ses efforts réalisés cette semaine\nMardi 10 octobre de 13h à 14h : Partager et échanger lors d’un moment convivial avec des cadeaux offerts aux courageux\n\nAmis co-voitureurs\, sortez vos meilleures blagues; Amis tramistes\, dégainez vos cartes d’abonnements; Amis cyclistes\, chauffez vos mollets; Amis trottinettistes\, huilez vos roulements à billes; Amis piétons\, fartez vos semelles ! \n
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SUMMARY:Soutenance de thèse -  Johannes Roos
DESCRIPTION:Salle de Conférence\, CGFB \n \n\nJohannes Roos\nIINS\nEquipe : Plasticité synaptique et microscopie à superrésolution\nThèse dirigée par : Valentin Nägerl\n \n\nTitre\nArkitekt : Une plateforme logicielle open-source pour la gestion de pipelines d’analyse en bioimagerie\nRésumé\n\nLe processes d’analyse de bio-image se sont transformés de manière spectaculaire au cours des dernières années\, accélérés par l’émergence de l’apprentissage profond (deep learning). En effet\, des défis autrefois considérés comme impossibles à relever\, tels que la segmentation en 3D de données microscopiques complexes ou la microscopie multidimensionnelle pilotée par les données (la microscopie intelligente semblent désormais réalisables\, et de nouvelles modalités d’imagerie battent des records à la fois en termes de résolution et de vitesse d’acquisition.  \nCette évolution s’accompagne d’une variété de nouvelles plateformes logicielles et d’outils\, ainsi que de l’exigence de ressources informatiques dédiées telles que les GPU. En raison de l’absence d’un cadre commun pour ces outils\, la gestion fastidieuse des données\, l’orchestration complexe et l’intégration pénible des nouvelles technologies sont devenues une réalité et limitent actuellement ces flux de travail avancés et distribués en matière d’imagerie biologique à un ensemble restreint d’experts en programmation.  \nEn outre\, la plupart des méthodes existantes sont encore limitées dans leurs capacités en temps réel et sont généralement restreintes à des flux d’analyse hors ligne\, où l’analyse a lieu après l’acquisition\, ce qui limite les flux de travail « intelligents » émergents\, où le résultat de l’analyse peut influencer l’acquisition.  \nCette thèse de doctorat présente un nouveau logiciel open-source qui sert d’intermédiaire entre les utilisateurs et les applications de bio-imagerie : Arkitekt. Arkitekt permet la conception visuelle et conviviale de flux de travail de bioimagerie modernes\, orchestrant les logiciels de bioimagerie populaires existants localement ou à distance de manière fiable\, efficace et en temps réel. Il s’interface avec les logiciels de visualisation et d’analyse interactifs les plus répandus\, comme ImageJ et Napari\, mais intègre aussi facilement les scripts des développeurs et les logiciels d’acquisition. \nCette thèse est organisée en 3 parties principales. Après une introduction générale sur l’histoire de l’analyse de bioimage et une revue détaillée des flux de travail d’analyse modernes\, elle décrit entièrement les principales caractéristiques d’Arkitekt. Elle illustre et valide ensuite Arkitekt et ses capacités sur des flux de travail de bioimagerie avancés représentatifs\, et discute de ses limites et de son potentiel. \nJury\n\nM. NAGERL Valentin\, Professeur des universités\, Université de Bordeaux\, Directeur de these\nMme. MANLEY Suliana\, Professeure des universités\, École polytechnique fédérale de Lausanne\, Rapporteur\nM. KERVRANN Charles\, Directeur de recherche\, Centre INRIA de l’Université de Rennes\, Rapporteur\nMme. MONTCOUQUIOL Mireille\, Directrice de recherche\, Neurocentre Magendie\, Examinateur\nMme. TESTA Ilaria\, Associate Professor\, SciFiLab\, Karonlinska Institute\, Guest\nM. SIBARITA Jean-Baptiste\, Research Engineer CNSR\, HDR\, IINS\, Bordeaux\, Guest\n\nPublications\n Imaging dendritic spines in the hippocampus of a living mouse by 3D-STED microscopy Stéphane Bancelin\, Luc Mercier\, Johannes Roos\, Mohamed Belkadi\, Thomas Pfeiffer\, Sun Kwang Kim\, U. Valentin Nägerl. PrePrint bioRxiv. 2023-02-01.  10.1101/2023.02.01.526326 – Fiche \n\n
URL:https://www.bordeaux-neurocampus.fr/event/soutenance-de-these-johannes-roos/
CATEGORIES:Thèses
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