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SUMMARY:Exposition : "Cell Immersion"
DESCRIPTION:Les Bassins des Lumières – Imp. Brown de Colstoun\, Bordeaux \n\nCell Immersion vous convie à un voyage Art & Science dans un monde microscopique méconnu : l’humain. \nL’œuvre est la première brique d’un projet d’envergure\, nommé Cell Worlds\, qui amène les images de microscopie là où elles ne sont jamais allées. Loin des laboratoires et des disques durs des scientifiques et au plus près des cellules humaines. Ici\, tout est bien réel\, et surtout vivant. Chaque visuel de l’exposition se compose de véritables cellules : de l’électrisant neurone au fragile embryon en passant par les mélancoliques flux sanguins du cerveau. Découvrez un univers aux couleurs chatoyantes et d’une diversité incroyable. \nCell Immersion est une première mondiale scientifique\, mettant en scène le vivant microscopique dans des proportions jamais tentées. C’est également un des plus grands showcases de la recherche scientifique\, regroupant de nombreuses équipes\, laboratoires et instituts du monde entier. Une preuve que la science et l’art n’ont pas de frontières. \nÀ travers l’émerveillement\, ce voyage saura éveiller votre curiosité scientifique. Au-delà du simple divertissement\, Cell Immersion vous invite à vous reconnecter avec le monde vivant microscopique qui est aujourd’hui trop inconnu\, trop peu contemplé et parfois trop mystifié. \n  \n\nRéalisation : Terence Saulnier et Renaud Pourpre \nComposition de la bande originale : Youenn Lerb \n– \nEntrée gratuite dans la limite des places disponibles\nPasse vaccinal et masque obligatoires \n\n  \nPour plus d’informations : https://www.bassins-lumieres.com/fr/cell-immersion \n
URL:https://www.bordeaux-neurocampus.fr/event/exposition-cell-immersion/
LOCATION:Les Bassins des Lumières\, Imp. Brown de Colstoun\, Bordeaux\, 33000\, France
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SUMMARY:Impromptu seminar - Gerti Beliu
DESCRIPTION:\nDr. Gerti BeliuRudolf Virchow Center for Integrative and Translational Bioimaging \nUniversity of Wuerzburg \nGermany \n\nVenue: salle Pyramide – Centre Broca Nouvelle-Aquitaine \n\nTitle\n“Genetic Code Expansion and Click Chemistry for super-resolution imaging in living cells” \nAbstract\nOptical nanoscopy has contributed significantly to our understanding of biological structures. Although steadily emerging fluorescence techniques are constantly improving spatio-temporal resolution and thus enable visualization of biological processes in real time\, there are still a number of challenges to overcome [1].\nSince the density of fluorophores controls the achievable structural resolution\, efficient and specific labeling with fluorescent probes is a decisive factor in super-resolution microscopy techniques. Despite recent progress in the development of new fluorophores with superior photophysical properties\, specific and efficient labeling of the molecule of interest with minimal linkage error remains a significant challenge. As the field moves towards higher spatial resolution\, the effective size of the label will be the main limiting factor of super-resolution microscopy\, demanding the development of efficient labeling methods with small dyes\, which can be site-specifically and quantitatively attached to a protein of interest with low linkage error [2-3].\nSite-specific introduction of unnatural amino acids (uAA) into proteins of interest followed by bioorthogonal click chemistry with tetrazine-dyes represents a broadly useful possibility to overcome current limitations and enable high-end fluorescence imaging with organic dyes. A particularly promising type of uAA include strained alkenes\, such as trans-cyclooct-2-ene (TCO)\, that can react with a 1\,2\,4\,5-tetrazine in an ultrafast\, specific and bioorthogonal click reaction.\nAdditionally\, the tetrazine moiety can elicit substantial quenching of many fluorescent dyes (e.g. red-absorbing oxazines and rhodamine derivatives) and thus be utilized for improved live-cell labeling and quantitative super-resolution imaging experiments under physiological and wash-free conditions. Furthermore\, this powerful tool can be applied to improve protein-protein interaction (PPI) assays [4-5]\, making them faster\, more accurate and easier to implement. \nIn conclusion\, new labeling techniques will enable previously impossible experiments with unseen reactivity and specificity while preserving biological function. Advances of optical microscopy in biological science will depend crucially on advances in sample preparation and labeling. \n[1] L Lelek\, M.\, Gyparaki\, M.T.\, Beliu\, G. et al. Single-molecule localization microscopy. Nat Rev  Methods Primers 1\, 39 (2021). https://doi.org/10.1038/s43586-021-00038-x \n[2] Beliu\, G. et al. Bioorthogonal labeling with tetrazine-dyes for super-resolution microscopy. Commun Biol 2\, 261 (2019). https://doi.org/10.1038/s42003-019-0518-z \n[3] Neubert*\, F.\, Beliu*. G.\, et al. Bioorthogonal click chemistry enables site-specific fluorescence labeling of functional NMDA receptors for super-resolution imaging. Angew. Chem. Int. Ed. 57\, 16364–16369 (2018). https://doi.org/10.1002/anie.201808951 \n[4] Beliu G.\, Altrichter. S.\, Guixa-Gonzalez\, R. et al. Tethered agonist exposure in intact adhesion/class B2 GPCRs through intrinsic structural flexibility of the GAIN domain. Mol. Cell. 81: 905–921 (2021). https://doi.org/10.1016/j.molcel.2020.12.042 \n[5] Bessa-Neto*\, D.\, Beliu*\, G. et al.\, Bioorthogonal labeling of transmembrane proteins with non-canonical amino acids allows access to masked epitopes in live neurons. Nature Communications (2021) https://doi.org/10.1038/s41467-021-27025-w \n
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CATEGORIES:A la une,Pour les scientifiques,Séminaire Impromptu
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SUMMARY:Soutenance de thèse - Vincent Martin
DESCRIPTION:Lieu :Amphithéâtre du laboratoire IMS à Talence\,\net sur Zoom à l’adresse :\nhttps://u-bordeaux-fr.zoom.us/j/8475497370?pwd=U0lHRWdMZnBXT0ZrV1kyZ3hueVpGZz09 \nSoutenance en français. \n\nTitre\nNouveaux biomarqueurs vocaux pour la détection automatique de la somnolence \nRésumé\nLa voix est un des outils les plus prometteurs de la médecine numérique. En association avec les compagnons virtuels médicaux\, l’estimation de symptômes à partir de marqueurs vocaux permettra à la fois le suivi à domicile de patients souffrant de maladies neuropsychiatriques chroniques\, et l’accès à des conseils personnalisés d’hygiène de vie pour la population générale. La somnolence\, présente dans de nombreuses pathologies et présentant une très forte prévalence à la fois chez les patients souffrant de maladies chroniques et en population générale\, est un symptôme privilégié pour cette approche.\nL’objectif des travaux présentés dans ce manuscrit est ainsi de compléter les informations collectées par les assistants virtuels lors de l’interaction des sujets avec ceux-ci\, en utilisant des marqueurs vocaux validés comme étant des marqueurs fiables de la somnolence. La démarche suivie est la suivante. \nDans un premier temps\, nous introduisons dans un premier temps les mécanismes de production de la voix et l’ensemble des pathologies qui peuvent interférer avec les différentes fonctions musculaires et neuro-musculaires impliquées\, avec une attention particulière portée sur les méthodologies employées pour l’enregistrement et l’annotation des corpus utilisés. \nEnsuite\, nous tentons d’établir une définition consensuelle de la somnolence en utilisant trois dictionnaires de référence de la langue française ; deux approches de fouille de texte~;~et enfin par l’intermédiaire d’une revue générale des outils conçus pour la mesurer. \nNous présentons ensuite notre propre corpus de patients atteints d’hypersomnie\, enregistrés au pôle universitaire de médecine du sommeil du CHU de Bordeaux sur une tâche de lecture à voix haute\, annotés avec des mesures de somnolence à la fois subjectives (questionnaires) et objectives (latence d’endormissement au Test Itératif de Latences d’Endormissement) validées par les médecins du CHU.\nCe corpus est ensuite comparé avec les autres corpus de l’état de l’art sur la détection de la somnolence dans la voix\, à partir desquels nous proposons des recommandations sur l’élaboration de tels corpus. Puis\, à l’aide d’une étude perceptuelle\, nous validons l’utilisation de la base TILE pour la détection de la somnolence dans la voix. \nSur la base de ce corpus\, nous élaborons quatre catégories de descripteurs vocaux\, mesurant deux dimensions de l’impact de la somnolence sur la voix. D’une part\, nous étudions des marqueurs de qualité acoustique de la voix ; d’autre part nous concevons des marqueurs de qualité de lecture\, divisés en trois sous-catégories : les erreurs de lecture faites par les patients\, leur automatisation à travers les erreurs faites par des systèmes de reconnaissance automatique de la parole\, et enfin les durées et emplacements des pauses de lecture.\nCes marqueurs sont validés sur différentes formes de somnolence (objective et subjective). \nEnfin\, nous proposons une méthodologie pour entraîner un classifieur dans la visée d’une utilisation clinique de ces descripteurs vocaux pour la détection de trois symptômes liés à la somnolence. Nous proposons une analyse détaillée des résultats obtenus et des descripteurs employés par le classifieur. Pour aller plus loin\, nous proposons ensuite de rapprocher le problème de classification de la réalité du raisonnement clinique en classifiant deux syndromes dérivés des précédents symptômes.\nEnfin\, dans cette même direction\, nous proposons des perspectives de recherche autour des réseaux de symptômes\, dans la cadre de la recherche en médecine numérique sur la somnolence et sur la psychiatrie numérique de manière plus générale. \nJury\n\n– Pr. Corinne Fredouille\, Univ. d’Avignon\, Rapporteuse– Pr. Isabel Trancoso\, Univ. de Lisbonne\, Rapporteuse– Dr. Pierre-Alexis Geoffroy\, Univ. de Paris\, Rapporteur– Dr. Véronique Delvaux\, FNRS – Univ. de Mons\, Examinatrice– Dr. Guy Fagherazzi\, Luxembourg Institute of Health\, Examinateur\n– Dr. Jean-Arthur Micoulaud-Franchi\, Univ. de Bordeaux\, Invité – Dr. Jean-Luc Rouas\, CNRS – LaBRI\, Directeur– Pr. Pierre Philip\, Univ. de Bordeaux\, Co-directeur \nA propos\n\nVincent MARTIN\nPhD Student – Sleepiness detection through voice – LaBRI / SANPSY\nENSEA Engineer – Multimedia signal processing\nhttps://www.researchgate.net/profile/Vincent_P_Martin \n
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CATEGORIES:Thèses
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