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SUMMARY:Thèse de Makhlad Chahid
DESCRIPTION:Le 19 décembre 2014 \nMicroscopie de fluorescence et de super résolution par échantillonnage compressif pour l’imagerie biologique  \nRésumé\nMes travaux de thèse portent sur l’application de la théorie de l’échantillonnage compressif (Compressed Sensing ou Compressive Sampling\, CS) à la microscopie de fluorescence\, domaine en constante évolution et outil privilégié de la recherche fondamentale en biologie. La récente théorie du CS a démontré que pour des signaux particuliers\, dits parcimonieux\, il est possible de réduire la fréquence d’échantillonnage d \nLa théorie du CS stipule qu’il est possible de reconstruire un signal\, sans perte d’information\, à partir de mesures aléatoires fortement incomplètes et/ou corrompues de ce signal à la seule condition que celui-ci présente une structure parcimonieuse. Nous avons développé une approche expérimentale inédite de la théorie du CS à la microscopie de fluorescence\, domaine où les signaux sont naturellement parcimonieux. La méthode est basée sur l’association d’une illumination dynamique structurée à champs large et d’une détection rapide à point unique. Cette modalité permet d’inclure l’étape de compression pendant l’acquisition. \nEn outre\, nous avons montré que l’introduction de dimensions supplémentaires (2D+couleur) augmente la redondance du signal\, qui peut être pleinement exploitée par le CS afin d’atteindre des taux de compression très importants. Dans la continuité de ces travaux\, nous nous sommes intéressés à une autre application du CS à la microscopie de super résolution\, par localisation de molécules individuelles (PALM/ STORM). Ces nouvelles techniques de microscopie de fluorescence ont permis de s’affranchir de la limite de diffraction pour atteindre des résolutions nanométriques. \nNous avons exploré la possibilité d’exploiter le CS pour réduire drastiquement les temps d’acquisition et de traitement. \nMots clefs: échantillonnage compressif\, microscopie de fluorescence\, parcimonie\, microscopie de super résolution\, redondance\, traitement du signal\, localisation de molécules uniques\, bio-imagerie.  \nJury\n\nValentin NÄGERL\nPU Bordeaux – Interdisplinary Institute for Neuroscience\nLaure BLANC FÉRAUD\nDR CNRS – Université de Nice Sophia-Antipolis – Rapporteur\nSylvain GIGAN\nPU- UPMC – NRS UMR 8552  – Rapporteur\nFlorent KRZAKALA \nPU École Normale Supérieure  – Examinateur\nVincent STUDER\nCR CNRS – directeur de thèse\nMaxime DAHAN\nDR CNRS – directeur de thèse\n\nDirecteurs de thèses\nVincent Studer\nChargé de Recherche CNRS  Interdisciplinary Institute for Neuroscience\, Bordeaux \nMaxime Dahan\nDirecteur de Recherche CNRS Directeur de l’UMR 168! Physico-Chimie Curie\, Paris \n
URL:https://www.bordeaux-neurocampus.fr/event/these-de-makhlad-chahid/
CATEGORIES:Thèses
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