{"id":19159,"date":"2018-01-09T23:01:07","date_gmt":"2018-01-09T22:01:07","guid":{"rendered":"https:\/\/neurodev-ng.u-bordeaux.fr\/j-b-sibarita-a-beghin-et-al-dans-nature-methods\/"},"modified":"2018-05-16T11:11:58","modified_gmt":"2018-05-16T09:11:58","slug":"j-b-sibarita-a-beghin-et-al-dans-nature-methods","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.bordeaux-neurocampus.fr\/en\/j-b-sibarita-a-beghin-et-al-dans-nature-methods\/","title":{"rendered":"J.B. Sibarita, A. Beghin et al. in Nature Methods<\/em>"},"content":{"rendered":"

Localization-based super-resolution imaging meets high-content screening.<\/strong><\/em><\/a>
\nBeghin A, Kechkar A, Butler C, Levet F, Cabillic M, Rossier O, Giannone G, Galland R, Choquet D, Sibarita JB. Nat Methods. 2017 Oct 30. doi: 10.1038\/nmeth.4486. [Epub ahead of print]
\n<\/em>Jean-Baptiste Sibarita team leader et Anne Beghin: Quantitative Imaging of the Cell\u00a0Institut Interdisciplinaire de Neurosciences \/ Bordeaux Neurocampus<\/p>\n

\n

La complexit\u00e9 immense du vivant requiert des approches syst\u00e9matiques \u00e0 grande \u00e9chelle pour trouver de nouvelles mol\u00e9cules qui pourraient \u00eatre le point de d\u00e9part de nouveaux m\u00e9dicaments.<\/strong>\u00a0L\u2019\u00e9quipe de recherche \u00ab Imagerie Quantitative de la Cellule \u00bb men\u00e9e par Jean-Baptiste Sibarita, en collaboration avec plusieurs autres \u00e9quipes au sein de l\u2019Institut Interdisciplinaire de Neurosciences de Bordeaux (IINS UMR CNRS 5297), a d\u00e9velopp\u00e9 une nouvelle approche de microscopie de super-r\u00e9solution bas\u00e9e sur la localisation de mol\u00e9cules uniques permettant le criblage haut-d\u00e9bit de conditions biologiques. Cette technique novatrice devrait permettre l\u2019utilisation des m\u00e9thodes de nanoscopie dans le processus de d\u00e9veloppement et d\u2019identification de nouveaux agents th\u00e9rapeutiques ciblant diverses pathologies.
\n<\/em><\/p>\n

Depuis plus d\u2019une vingtaine d\u2019ann\u00e9es,<\/strong>\u00a0Les laboratoires de biologie et l\u2019industrie pharmaceutique utilisent quotidiennement des approches de microscopie dites de \u00ab criblage \u00e0 haut d\u00e9bit \u00bb, ou High Content Screening (HCS), afin de tester l\u2019efficacit\u00e9 d\u2019un grand nombre de mol\u00e9cules le plus rapidement possible. Plus r\u00e9cemment, le d\u00e9veloppement des approches de microscopie de super-r\u00e9solution (SR) par localisation de mol\u00e9cules uniques permet de collecter un ensemble de nouveaux param\u00e8tres des propri\u00e9t\u00e9s cellulaires \u00e0 l\u2019\u00e9chelle nanom\u00e9trique. Il devient ainsi possible de d\u00e9cortiquer les propri\u00e9t\u00e9s d\u2019organisation et de dynamique de millions de mol\u00e9cules par cellule.<\/p>\n

N\u00e9anmoins, ces technologies \u00e9taient jusqu\u2019\u00e0 pr\u00e9sent relativement lentes et manuelles et de fait totalement inadapt\u00e9es au criblage selon les standards industriels ou ceux des laboratoires de recherche appliqu\u00e9e.<\/p>\n

L\u2019\u00e9quipe interdisciplinaire compos\u00e9e de chercheurs et ing\u00e9nieurs a r\u00e9ussi \u00e0 d\u00e9velopper une nouvelle approche demicroscopie de super-r\u00e9solution<\/strong>\u00a0bas\u00e9e sur la localisation de mol\u00e9cules uniques permettant le criblage haut-d\u00e9bit de centaines de conditions biologiques. Pour la premi\u00e8re fois, il est possible de suivre au c\u0153ur des cellules vivantes l\u2019effet direct de diff\u00e9rents traitements pharmacologiques et\/ou de conditions biologiques sur l\u2019organisation et la dynamique de centaines de millions de mol\u00e9cules avec une pr\u00e9cision nanom\u00e9trique. Pour ce faire, les auteurs ont exploit\u00e9 leur savoir-faire unique dans le domaine de la microscopie de super-r\u00e9solution pour d\u00e9velopper un nouvel instrument r\u00e9volutionnaire. Celui-ci est compos\u00e9 d\u2019un microscope enti\u00e8rement automatis\u00e9 et d\u2019une plateforme logicielle innovante permettant de piloter la s\u00e9quence de criblage, de traiter en temps r\u00e9el la quantit\u00e9 massive d\u2019informations g\u00e9n\u00e9r\u00e9e par la technique de super-r\u00e9solution et de repr\u00e9senter ces donn\u00e9es de mani\u00e8re intelligible pour toutes les conditionsbiologiques test\u00e9es. Un prototype fonctionnel, facile d\u2019utilisation par des \u00e9quipes de recherche de diff\u00e9rents domaines (neuroscience, canc\u00e9rologie, immunologie…), est localis\u00e9 au sein de l\u2019IINS \u00e0 Bordeaux. Il devrait notamment int\u00e9grer le processus de recherche des industries pharmaceutiques, \u00e0 travers des collaborations d\u2019ores et d\u00e9j\u00e0 pr\u00e9vues, et contribuer \u00e0 identifier de nouveaux traitements en immunoth\u00e9rapie des cancers.
\n\"\"<\/a>
\n<\/span><\/p>\n

Exemple de criblage de super-r\u00e9solution sur le cytosquelette de cellules canc\u00e9reuses r\u00e9alis\u00e9 sans intervention manuelle sur une plaque 96 puits, g\u00e9n\u00e9rant une base de donn\u00e9es de plusieurs centaines de millions de donn\u00e9es de mol\u00e9cules.<\/em><\/p>\n

La description de la m\u00e9thode a \u00e9t\u00e9 publi\u00e9e dans la revue Nature Methods, \u00ab When high content screening meets super resolution microscopy \u00bb par Beghin et al.<\/p>\n

Ce d\u00e9veloppement a re\u00e7u le soutien de la R\u00e9gion Nouvelle Aquitaine, de l\u2019infrastructure France Bio Imaging, du LabEx BRAIN et de l\u2019IdEx de l\u2019Universit\u00e9 de Bordeaux.<\/em><\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

Localization-based super-resolution imaging meets high-content screening. <\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"categories":[71],"tags":[],"class_list":["post-19159","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry","category-highlight-en"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.bordeaux-neurocampus.fr\/en\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/19159","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.bordeaux-neurocampus.fr\/en\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.bordeaux-neurocampus.fr\/en\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.bordeaux-neurocampus.fr\/en\/wp-json\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.bordeaux-neurocampus.fr\/en\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=19159"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/www.bordeaux-neurocampus.fr\/en\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/19159\/revisions"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.bordeaux-neurocampus.fr\/en\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=19159"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.bordeaux-neurocampus.fr\/en\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=19159"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.bordeaux-neurocampus.fr\/en\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=19159"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}